微波污水处理技术在水处理领域内不是万能的，也不是唯一的方法，但因其可靠性、稳定性、先进性、突破性、广谱性和高效性等诸多优点，可以作为首选的水处理方法，它有其他传统的水处理方法无可比拟的优势： 

1、工艺流程短，絮凝沉淀速度快，占地面积小。用微波污水处理技术日处理2400吨水的工程，总占地面积不到300m2，其中微波能水处理机组设备仅占地64 m2，约为普通活性污泥法处理工艺的1/6—1/10（传统方法总占地面积大于2000m2）。 

2、工程投资强度低，建设工期短。由于设备本身的独特性，不必铺设庞大的管网和水池，土建简单；设备结构紧凑，且为组块拼装式，施工安装快捷方便，大大缩短工期，日处理量为2400m3???的单套机组的工程安装半个月左右即可完成。设备运行时，小时耗电仅为40度，折合0.4度/吨水，计算综合运营成本约为0.5～1.2元/吨水。 

3、调试周期短。微波污水处理技术由于工艺流程短，没有多个单元的繁杂的调试和联机调试阶段，一般调试过程只需几天即可进入连续运行。 

4、杀菌灭藻能力强。微波对菌、藻类有高频穿透作用，杀伤能力极强，在短时间内杀灭微生物，有很强的杀菌灭藻功能，其中蓝藻在微波场中只需非常短的时间即由微细粒汇聚呈大颗粒变黄沉降与水分离。 

5、适应性强，处理效率高。微波污水处理技术可广泛应用于市政污水、工业废水、小区中水回用等行业的水处理，可以作为任何工艺的一部分进行应用处理。微波污水处理技术可实现污水的持续再利用，出水可达标排放或再利用。